More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0026 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1095  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.34 
 
 
691 aa  888  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1836  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.91 
 
 
689 aa  669  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0545  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.11 
 
 
696 aa  719  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2334  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit / succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  70.08 
 
 
700 aa  984  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.530303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0026  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
709 aa  1417  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0502559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.61 
 
 
293 aa  283  7e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  47.57 
 
 
291 aa  280  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  50 
 
 
300 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  49.65 
 
 
300 aa  275  2e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.87 
 
 
299 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0230  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.1 
 
 
294 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2102  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  49.82 
 
 
290 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174971  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.1731e-07  unclonable  1.52569e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.24479e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.26587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
300 aa  270  6e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  49.47 
 
 
300 aa  270  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.53221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.3 
 
 
329 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0517  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.47 
 
 
294 aa  270  8e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  46.5 
 
 
302 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  46.5 
 
 
302 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0437  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  45.79 
 
 
315 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.188217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  46.15 
 
 
302 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.07 
 
 
300 aa  268  3e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.16664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4692  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.82 
 
 
278 aa  267  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243539  normal  0.0624727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.23 
 
 
291 aa  266  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1059  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  48.08 
 
 
291 aa  266  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.35 
 
 
290 aa  266  8e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.18 
 
 
292 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2882  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha  47.9 
 
 
293 aa  266  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0288  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.65 
 
 
290 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.9 
 
 
295 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  46.37 
 
 
294 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.38 
 
 
290 aa  265  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.9 
 
 
295 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.9 
 
 
295 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1125  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.72 
 
 
294 aa  264  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0337157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2163  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.37 
 
 
294 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_002620  TC0209  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  48.77 
 
 
291 aa  264  5e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.35 
 
 
291 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.74 
 
 
294 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  47.74 
 
 
294 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.91 
 
 
290 aa  263  9e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2819  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.46 
 
 
296 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.55 
 
 
290 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4185  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.4 
 
 
294 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0073  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.08 
 
 
289 aa  262  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3756  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.4 
 
 
294 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1669  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.4 
 
 
294 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0827  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  46.85 
 
 
293 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.623831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3508  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.4 
 
 
294 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214073  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.94 
 
 
288 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.27 
 
 
339 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1585  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.37 
 
 
294 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  48.59 
 
 
294 aa  260  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.54 
 
 
290 aa  260  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1556  succinate-CoA ligase (ADP-forming), alpha subunit  48.59 
 
 
294 aa  260  6e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0185  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.42 
 
 
294 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0921  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.72 
 
 
294 aa  260  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1221  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  48.06 
 
 
290 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1618  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.2 
 
 
294 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161145  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1927  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.38 
 
 
295 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0416872  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3512  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  45.55 
 
 
295 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.39 
 
 
294 aa  259  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0155  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.02 
 
 
294 aa  259  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0491  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.02 
 
 
294 aa  259  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.18 
 
 
291 aa  259  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  46.53 
 
 
290 aa  258  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0403  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.15 
 
 
300 aa  258  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0844836  hitchhiker  0.0012368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1645  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.01 
 
 
295 aa  258  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  0.44525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1989  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  48.62 
 
 
295 aa  258  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  47.54 
 
 
291 aa  257  5e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.52 
 
 
308 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3739  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.52 
 
 
290 aa  257  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  unclonable  3.21721e-10 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  46.53 
 
 
290 aa  257  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  47.2 
 
 
293 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143561  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  45.96 
 
 
296 aa  257  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2203  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  47.2 
 
 
293 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  46.67 
 
 
290 aa  256  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  46.67 
 
 
290 aa  256  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  46.83 
 
 
290 aa  256  1e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0279  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.37 
 
 
294 aa  256  1e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0600383 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30915  predicted protein  48.26 
 
 
344 aa  256  1e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0115  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.54 
 
 
291 aa  256  1e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1209  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  44.41 
 
 
291 aa  256  1e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.72 
 
 
293 aa  256  1e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.06874e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.87 
 
 
308 aa  256  1e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.16 
 
 
290 aa  255  2e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0118943  unclonable  1.83638e-05 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.52 
 
 
291 aa  255  2e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  46.5 
 
 
290 aa  255  2e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1658  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  47.59 
 
 
293 aa  255  2e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0963642 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0333  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.81 
 
 
299 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.637243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0192  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  47.37 
 
 
294 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0394  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  46.67 
 
 
294 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  46.93 
 
 
290 aa  254  4e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>