More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3329 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  63.39 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  55.69 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  55.98 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  62.15 
 
 		 263 aa  248  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  62.15 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  61.42 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  51.37 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.67 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.43 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  32.43 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 463 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.9 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.12 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.27 
 
 		 659 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.33 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.78 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>