286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0198 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 139 aa  286  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  75.37 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  77.1 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  76.34 
 
 		 137 aa  217  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  75.36 
 
 		 150 aa  214  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.22 
 
 		 142 aa  213  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.78 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.31 
 
 		 133 aa  180  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.07 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.61 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.61 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  60.9 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.09 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.36 
 
 		 135 aa  175  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.09 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.52 
 
 		 139 aa  174  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.02 
 
 		 134 aa  173  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.25 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.35 
 
 		 136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.41 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.09 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.12 
 
 		 140 aa  169  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.83 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.76 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.23 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.4 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.74 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.47 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.54 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.15 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.99 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.44 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.26 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  60.77 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.97 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.21 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.54 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.14 
 
 		 136 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  40.48 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.67 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.27 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.3 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.89 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.98 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.64 
 
 		 543 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.22 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.46 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.09 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.55 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  39.68 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.04 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.33 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.71 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.51 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>