129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0104 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  334  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  54.37 
 
 
160 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  52.5 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
165 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
162 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  49.06 
 
 
174 aa  173  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 
160 aa  170  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  54.86 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
160 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 
171 aa  156  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  48.45 
 
 
185 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
163 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
191 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  53.62 
 
 
139 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  47.5 
 
 
169 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
163 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
169 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  45.57 
 
 
173 aa  147  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
167 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  46.25 
 
 
169 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  43.75 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  44.72 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
189 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  43.64 
 
 
177 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 
189 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  43.56 
 
 
178 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
193 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  42.41 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  42.41 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  44.08 
 
 
183 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  42.41 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.01 
 
 
174 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  39.63 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
159 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
161 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.52 
 
 
338 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  34.81 
 
 
195 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
161 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
166 aa  84  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  29.38 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  58.9  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  27.1 
 
 
533 aa  58.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  25.78 
 
 
310 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.14 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  22.29 
 
 
240 aa  54.3  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  25.17 
 
 
166 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  30.34 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  30.34 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  25.66 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  25.66 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  29.94 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
181 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000258649  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0396  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617467  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  28.17 
 
 
163 aa  47.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  28.41 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  30 
 
 
164 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  24.71 
 
 
175 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  30 
 
 
202 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  28.18 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4162  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0539186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1496  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1453  acetyltransferase  23.21 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
194 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  28.41 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  27.73 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  26.43 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  26.45 
 
 
373 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  32.09 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  24.35 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.85 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  38.46 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>