68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4162 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4162  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
181 aa  348  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0539186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4349  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
187 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.848023  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
181 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
192 aa  97.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572414  normal  0.835095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2002  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000155938  hitchhiker  0.00420903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3175  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00585025  hitchhiker  0.0000100489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3149  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000175005  hitchhiker  0.00000000160471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2543  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00522491  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00189616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2852  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.84 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.586337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
333 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2126  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.05 
 
 
322 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0111  diamine N-acetyltransferase  24.85 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000137834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0126  diamine N-acetyltransferase  24.85 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0081  spermidine n(1)-acetyltransferase  24.71 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000286884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0317  spermidine n(1)-acetyltransferase  27.12 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000406096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  33.98 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  33.98 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6513  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00143605  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.2 
 
 
175 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.46 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  35.71 
 
 
364 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0299  hypothetical protein  32.26 
 
 
98 aa  44.3  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3471  acetyltransferase, gnat family  27.68 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  23.45 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2997  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2725  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  38.82 
 
 
323 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719898 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0638  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.37 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
322 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.290046  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2767  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000158462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  25.78 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5535  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
364 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
342 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  32.52 
 
 
898 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3965  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.1 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
367 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
169 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
169 aa  42  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
909 aa  41.6  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
169 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  43.08 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
902 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  25.51 
 
 
170 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
323 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  23.4 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
212 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
150 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172633  normal  0.38556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  30.59 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.62 
 
 
147 aa  41.2  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1661  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
174 aa  40.8  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4266  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  21.35 
 
 
180 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.920622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>