72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3936 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572414  normal  0.835095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2002  GCN5-related N-acetyltransferase  88.46 
 
 
182 aa  330  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4349  GCN5-related N-acetyltransferase  56.57 
 
 
187 aa  197  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.848023  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  54.29 
 
 
181 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  54.17 
 
 
182 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210166 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4162  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0539186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  27.52 
 
 
901 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2953  acetyltransferase, GNAT family  28.44 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.323576  hitchhiker  0.000000100965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  26.53 
 
 
332 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2378  acetyltransferase, GNAT family  26.61 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2447  acetyltransferase  25.69 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000832578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2168  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.61 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2225  GCN5-related N-acetyltransferase  23.7 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00859735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2181  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.69 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000136101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2248  acetyltransferase  25.69 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000532423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2412  acetyltransferase  25.69 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2430  acetyltransferase, GNAT family  25.69 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.32582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2511  acetyltransferase, GNAT family  25.69 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.037927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
177 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  28.67 
 
 
926 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3327  GCN5-related N-acetyltransferase  23.29 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.796902  normal  0.13657 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  25.31 
 
 
911 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
903 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1638  GCN5-related N-acetyltransferase  24.78 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.82 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3725  putative acetyltransferase YhhY  29.67 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3884  putative acetyltransferase YhhY  29.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4759  putative acetyltransferase YhhY  29.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  0.225822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  27.21 
 
 
886 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03245  hypothetical protein  29.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0209792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0272  putative acetyltransferase YhhY  29.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.417468  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03292  predicted acetyltransferase  29.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0151809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3920  putative acetyltransferase YhhY  29.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3640  putative acetyltransferase YhhY  29.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156891  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  25.45 
 
 
868 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  24 
 
 
329 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1499  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
161 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0364311  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2852  GCN5-related N-acetyltransferase  22.61 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  25.76 
 
 
197 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0793594  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  36.99 
 
 
533 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
231 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.285514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  24.24 
 
 
909 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  24.49 
 
 
332 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  29.73 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0032  GCN5-related N-acetyltransferase  26.37 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  24.49 
 
 
332 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3390  phosphinothricin acetyltransferase  30.85 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.598414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  25.56 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1454  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  24.2 
 
 
181 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74926  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 
179 aa  41.6  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  24.49 
 
 
332 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2440  phosphinothricin acetyltransferase  30.85 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1187  phosphinothricin acetyltransferase  30.85 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1423  phosphinothricin acetyltransferase  30.85 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
175 aa  41.2  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.4166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2997  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
166 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1914  phosphinothricin acetyltransferase  30.85 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
151 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0308502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2318  acetyltransferase  30.85 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2279  acetyltransferase  30.85 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.14 
 
 
161 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>