45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0299 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  32.5 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  36.62 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3705  hypothetical protein  28.89 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01490  predicted acetyltransferase  34.85 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  28.38 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  29.58 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  28.57 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  29.73 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  31.43 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4162  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0539186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 91 aa  43.9  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  27.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  25.42 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  28.38 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0314  acetyltransferase  26.92 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  29.87 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  32.69 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  41.3 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  32.79 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  30.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  25.35 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  38 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  36.67 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  28.17 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  32.14 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  29.82 
 
 		 93 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 97 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3723  hypothetical protein  24.62 
 
 		 139 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>