86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_01490  predicted acetyltransferase  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  45.26 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  39.62 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  40.95 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  38.61 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  38.24 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  40.21 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  39.6 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  42.11 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  40.78 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  38.71 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  49.15 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  34.65 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 
834 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  52.54 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
96 aa  58.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  37.78 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  40.68 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  31.96 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12480  predicted acetyltransferase  35.45 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441566  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  32.99 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  34.02 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  35.79 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  36.9 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  34.91 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  43.3 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  32.61 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
94 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  28.89 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  31.87 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0299  hypothetical protein  34.85 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  34.31 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3734  hypothetical protein  30.95 
 
 
111 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  32.56 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  36.54 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  32.29 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  31.13 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  32.71 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  37.29 
 
 
113 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  28.87 
 
 
93 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  36.84 
 
 
98 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0651  hypothetical protein  25.51 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  33.33 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  26.88 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  32.79 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  30.68 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  33.9 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  33.9 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  33.9 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  35.96 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  32.14 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  35.23 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  39.66 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  37.29 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0299  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
209 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  26.04 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5016  hypothetical protein  38.46 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0775748  normal  0.0369444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  36.07 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  33 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  34.48 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  28 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  36 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  36 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  34.09 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  32.95 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  34.09 
 
 
93 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  34.09 
 
 
93 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  29.25 
 
 
119 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  34.83 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  40.35 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  29.89 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  28.26 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  38.98 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  32.32 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  34.83 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  31.58 
 
 
90 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>