136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1504 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  56.25 
 
 
95 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  49.44 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  43.18 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  42.05 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  45.56 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  41.38 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  38.2 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  39.78 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  42.7 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  42.55 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  44.19 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  38.64 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  38.95 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  42.22 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  44.71 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  43.33 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  33.71 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  42.86 
 
 
96 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  39.08 
 
 
96 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  39.29 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  39.77 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  39.08 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  37.78 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  51.56 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  40.21 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  41.57 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  40.23 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  43.43 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  34.44 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  28.09 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  39.24 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  34.09 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  34.44 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  38.89 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  35.14 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  35.14 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  34.44 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  36.25 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  30.77 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  37.35 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  43.24 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  35.37 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  33.78 
 
 
98 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  39.24 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
834 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  36.23 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  34.88 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  34.88 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  34.88 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  37.97 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  35.14 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  36.71 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3705  hypothetical protein  39.19 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  38.6 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  34.72 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0103  hypothetical protein  27.84 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3734  hypothetical protein  29.67 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  36.78 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  36.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  37.8 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  35.23 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  32.56 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  27.38 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  29.41 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  36.99 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  40.45 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  29.73 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  32.18 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  28.09 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  36.25 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  43.33 
 
 
377 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  36.49 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3723  hypothetical protein  31.65 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  41.51 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03910  predicted acetyltransferase  39.34 
 
 
120 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  34.38 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  34.38 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>