87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2274 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  96.84 
 
 		 117 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  77.89 
 
 		 115 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  75.27 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  75.27 
 
 		 93 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  75.27 
 
 		 93 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  75.27 
 
 		 93 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  74.19 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  75.27 
 
 		 94 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  68.82 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  40.23 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  39.74 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  39.74 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  44.87 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  38.75 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  42.68 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  38.75 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  39.51 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  37.5 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  37.04 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  39.74 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  48.72 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  35.44 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  37.18 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  36.05 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  32.1 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  31.11 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  30.95 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  36.78 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  35.29 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  32.95 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  26.97 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  32.53 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  30 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  34.57 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  30.49 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  34.29 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  25.93 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  34.57 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  32.81 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  36.36 
 
 		 377 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  34.25 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  33.73 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  28.74 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  29.41 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  33.72 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  29.41 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  28.05 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  33.72 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  25.58 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  31.71 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  27.91 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  28.05 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  32.1 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  31.08 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  41.67 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  32.43 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  25.29 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  32.43 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  32.43 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  33.82 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  30.95 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01490  predicted acetyltransferase  34.83 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  29.49 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  32.18 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  39.58 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  34.94 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  26.6 
 
 		 89 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>