102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1868 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  226  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  52.88 
 
 
110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  52.17 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  44.12 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  47.31 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  46.07 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  43.96 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  44.09 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  44.19 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  43.01 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  40.86 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  41.11 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  43.48 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  46.51 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  48.86 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  44.94 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  40.48 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  36.9 
 
 
834 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  32.61 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  38.89 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  39.77 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  38.83 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  38.64 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  35.29 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  34.09 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3734  hypothetical protein  40.23 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  40.91 
 
 
99 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  42.53 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  40.24 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  37.65 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  37.65 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  37.65 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  37.35 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  34.15 
 
 
92 aa  58.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  36.67 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  40.26 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  31.91 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  32.26 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  38.46 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  31.33 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  38.55 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  41.86 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  33.72 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  38.04 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  34.18 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  36.84 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1099  hypothetical protein  45.45 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54744 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03910  predicted acetyltransferase  39.58 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  36.05 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  34.09 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  36.05 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  36.47 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  37.36 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  35.16 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  37.36 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  36.05 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  34.52 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  37.14 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  34.21 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  25.93 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  35.71 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0164  hypothetical protein  35.16 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  31.17 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  32.94 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  33.77 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  29.89 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  34.09 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  34.62 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  30.11 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0075  hypothetical protein  35.59 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  28.41 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5016  hypothetical protein  35.09 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0775748  normal  0.0369444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0651  hypothetical protein  29.41 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  28.75 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  30.61 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  24.14 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  32.89 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0096  hypothetical protein  39.62 
 
 
93 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  22.09 
 
 
94 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  29.55 
 
 
93 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10410  predicted acetyltransferase  29.47 
 
 
101 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0185042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  34.57 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  30.43 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  32 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1514  acetyltransferase  29.35 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231957  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  32.2 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0308  acetyltransferase-like protein  27.27 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01490  predicted acetyltransferase  32.32 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>