130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1960 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  196  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  60.22 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  51.58 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  50 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  50.54 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  47.37 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  44.57 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  54.12 
 
 
111 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  46.74 
 
 
94 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  51.09 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  51.72 
 
 
119 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  51.14 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  46.67 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  41.76 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  50 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  43.16 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  44.05 
 
 
834 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  47.31 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  44.09 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  47.25 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  38.3 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  39.56 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  42.86 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  45.36 
 
 
102 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  53.57 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  43.96 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  39.13 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  48.31 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  44.58 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  46.91 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  38.64 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  46.07 
 
 
96 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  51.14 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  43.18 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  37.36 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  38.71 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  37.63 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  40.96 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  39.13 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03910  predicted acetyltransferase  48.72 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  39.56 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  37.23 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  32.22 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  30.85 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1514  acetyltransferase  42.86 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231957  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  41.86 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  41.11 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  35.96 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  36.96 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  40.96 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  38.55 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  36.67 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  38.82 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  45.61 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3734  hypothetical protein  35.96 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  42.86 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  35.9 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12480  predicted acetyltransferase  52.17 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  32.97 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3723  hypothetical protein  35.71 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  35.87 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  32.97 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  25 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  37.76 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  38.16 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0164  hypothetical protein  38.2 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  28.24 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  35.87 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0651  hypothetical protein  32.94 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  26.09 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  42.11 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  36.84 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  40.98 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  31.91 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  41.82 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  30.11 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  41.07 
 
 
377 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  32.22 
 
 
89 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  26.09 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  33.8 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  38.46 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  34.94 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  32.61 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  28.42 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3705  hypothetical protein  26.37 
 
 
92 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1099  hypothetical protein  43.08 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  32.91 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01490  predicted acetyltransferase  30.68 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>