80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3447 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  196  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  97.85 
 
 
93 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  91.3 
 
 
115 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  78.49 
 
 
161 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  79.57 
 
 
94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  81.11 
 
 
90 aa  156  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  80.65 
 
 
94 aa  156  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  76.34 
 
 
117 aa  154  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  75.27 
 
 
95 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  46.34 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  39.76 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  40.74 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  38.75 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  38.75 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  39.29 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  38.75 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  38.75 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  35.37 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  48.75 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  35.8 
 
 
98 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  41.98 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  32.61 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  36.71 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  32.61 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  38.27 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  37.18 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  35.44 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  30.86 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  36.14 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  34.12 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  32.91 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  36.23 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  35.9 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  33.33 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  34.62 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  32.1 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  32.5 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  33.75 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  26.51 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  34.62 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  39.66 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  34.94 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  35 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  30.68 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  28.41 
 
 
108 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  37.7 
 
 
377 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  26.58 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  27.69 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  34.72 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  32.47 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  30.43 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  30.12 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  30.12 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  33.85 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  28.05 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  29.35 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  32.18 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  32.05 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  40.68 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01490  predicted acetyltransferase  34.09 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154378  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  30.23 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
113 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
99 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
113 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  30.49 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  42.11 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  32.95 
 
 
98 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>