128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2946 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  46.43 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  50.57 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  46.81 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  43.68 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  42.17 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  38.1 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  38.46 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  40 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  43.9 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  43.04 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  40.48 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  42.31 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  44.87 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  36.9 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  37.76 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  42.17 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  36.14 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  39.47 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  41.57 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  43.59 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  36.84 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  38.16 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  36.84 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  40.48 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  37.33 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  38.67 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  39.51 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  37.08 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  33.78 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  34.83 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  40.45 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  41.98 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  35 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  41.46 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  42.31 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  41.98 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  41.98 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  37.35 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  39.53 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  36.25 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  44.16 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  32.97 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  38.16 
 
 		 834 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  36.08 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  37.08 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  37.84 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  38.37 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  36.84 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  41.1 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  34.09 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  40.26 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  37.08 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  36.78 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  34.09 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  34.09 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  34.09 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  35.56 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  41.56 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  37.8 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  41.56 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  28.72 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  31.87 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  40.26 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  30.77 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03910  predicted acetyltransferase  37.35 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  37.68 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  36.59 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  42.62 
 
 		 377 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  32 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  37.63 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  35.9 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  34.12 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  40.98 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  31.08 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  36.59 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  36.67 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  44.23 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  30.49 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  32.14 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>