74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5016 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5016  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  208  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0775748  normal  0.0369444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  53.12 
 
 
111 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  51.55 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  34.48 
 
 
102 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  33.77 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  34.83 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  39.62 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  31.03 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  25.29 
 
 
93 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  33.82 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  32 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  34.48 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  32 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  36.21 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  32.61 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  41.51 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
91 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  34.09 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  25.84 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  32.86 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  39.62 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  34.12 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  29.41 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  32.53 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  35.09 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  36.84 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  37.18 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0308  acetyltransferase-like protein  29.33 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  33.33 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  24.71 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01490  predicted acetyltransferase  38.46 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154378  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  31.51 
 
 
104 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  33.33 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  24.71 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  31.25 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  30.14 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  40.82 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  32.76 
 
 
114 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  35 
 
 
93 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  32.84 
 
 
100 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  35.42 
 
 
834 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  28.24 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  35.19 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  31.33 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  31.33 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  31.33 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  31.33 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  31.33 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  29.55 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  35.85 
 
 
377 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  25.68 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  30.12 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  30.12 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1099  hypothetical protein  31.37 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  35.42 
 
 
97 aa  40  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>