50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1099 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1099  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  38.95 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  42.11 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  43.62 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  41.49 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03910  predicted acetyltransferase  33.33 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  46 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  54.72 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  38.96 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  45.61 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  43.14 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  41.98 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 
834 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  37.93 
 
 
123 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  42 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  41.67 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
97 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  38.24 
 
 
118 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  47.06 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  43.08 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  38.6 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  41.51 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  39.44 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  47.37 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  34.67 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  39.66 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  31.67 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  34.52 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  38.46 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  36.07 
 
 
113 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  32.84 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  31.03 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  34.83 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  38.78 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0308  acetyltransferase-like protein  35.56 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  41.27 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  32.31 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
95 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>