88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4595 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  98.89 
 
 
90 aa  183  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  98.89 
 
 
90 aa  183  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  98.89 
 
 
90 aa  183  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  83.33 
 
 
90 aa  163  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3705  hypothetical protein  70 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  44.32 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  45.45 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  45.45 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  50.63 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  42.53 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  32.93 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  40.96 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  41.18 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  37.18 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  35.71 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  37.84 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  34.29 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  36.11 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  40.74 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  29.89 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  32.88 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  32.88 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  36.9 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0308  acetyltransferase-like protein  33.78 
 
 
91 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  38.18 
 
 
114 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  33.75 
 
 
93 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  50 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  36.11 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  28.05 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  29.63 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0075  hypothetical protein  29.49 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  29.41 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  37.29 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  38.89 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  29.17 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  30.88 
 
 
98 aa  47.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  31.65 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  28.92 
 
 
91 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  28.57 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  34.55 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  30.68 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  28.99 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  34.62 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  32.2 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  32.73 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0299  hypothetical protein  27.78 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  25.71 
 
 
377 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  32.2 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  28.21 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  30.51 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  27.4 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  35.09 
 
 
96 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  29.09 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3723  hypothetical protein  30.99 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  31.48 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  34.55 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  32.73 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  28.85 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  32.73 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  32.73 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  26.97 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  32.73 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  26.19 
 
 
113 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03910  predicted acetyltransferase  34.55 
 
 
120 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5016  hypothetical protein  31.33 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0775748  normal  0.0369444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  43.9 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  29.09 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  29.09 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  27.71 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  25.88 
 
 
94 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  29.03 
 
 
118 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>