77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2548 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  75.86 
 
 
87 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  63.22 
 
 
91 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  52.5 
 
 
89 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  39.53 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  37.93 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  39.08 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  39.33 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  38.16 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  37.93 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  38.37 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  34.09 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  37.93 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  34.52 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  37.65 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  39.24 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  34.48 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  33.33 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  34.52 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  35.23 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  31.33 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  31.46 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  30.34 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  28.92 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  27.27 
 
 
97 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  27.16 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  32.58 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  26.14 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  36.05 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  34.15 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  35.29 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  34.15 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  34.15 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  32.22 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  32.5 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  33.8 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  28.09 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  32.22 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  34.15 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  29.21 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  34.15 
 
 
103 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  28.09 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  24.72 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  33.33 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0103  hypothetical protein  20.45 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3723  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  29.89 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  34.88 
 
 
377 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  30.34 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  32.14 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  33.93 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  29.89 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  34.48 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 
834 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  36.51 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  31.65 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0308  acetyltransferase-like protein  29.21 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  35.85 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  44.19 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  32.1 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  30.3 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  29.09 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  28.12 
 
 
123 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  27.27 
 
 
108 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  28.09 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0299  hypothetical protein  25.35 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  41.67 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>