33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2002 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2002  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
182 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  88.46 
 
 
182 aa  330  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572414  normal  0.835095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4349  GCN5-related N-acetyltransferase  57.23 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.848023  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  55.49 
 
 
181 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  55.76 
 
 
182 aa  178  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210166 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
192 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4162  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0539186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  26.53 
 
 
332 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  24.83 
 
 
901 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
903 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
195 aa  45.4  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  24.37 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
329 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1986  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
345 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.583564  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2551  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1638  GCN5-related N-acetyltransferase  24.78 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.86 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
332 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.46 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 
860 aa  41.6  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0793594  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 
202 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.772971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  24.42 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  24.43 
 
 
150 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  23.85 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  28.83 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>