More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0490 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  70.93 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  69.05 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>