228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2942 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  819    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  68.62 
 
 
392 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  58.07 
 
 
405 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  55.84 
 
 
396 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  56.01 
 
 
402 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  53.03 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  53.67 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  49.75 
 
 
401 aa  435  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  49.36 
 
 
397 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.91 
 
 
504 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.27 
 
 
485 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.89 
 
 
500 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.02 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  51.02 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.02 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.02 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.02 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  51.02 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.02 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.76 
 
 
494 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.77 
 
 
479 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  49.49 
 
 
493 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  49.75 
 
 
499 aa  411  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  51.02 
 
 
479 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.26 
 
 
479 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.26 
 
 
479 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.26 
 
 
479 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.51 
 
 
479 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50.25 
 
 
498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  49.49 
 
 
505 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  49.49 
 
 
482 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  50 
 
 
503 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  44.5 
 
 
399 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.36 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  39.29 
 
 
395 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  40.25 
 
 
405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  40.15 
 
 
401 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  41.01 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  39.44 
 
 
404 aa  309  5e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.82 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 
404 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  40.63 
 
 
387 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  36.93 
 
 
404 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  38.64 
 
 
402 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  35.93 
 
 
404 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 
400 aa  293  4e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  36.48 
 
 
407 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 
404 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  38.56 
 
 
387 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.24 
 
 
400 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  36.27 
 
 
403 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 
402 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 
407 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  37.53 
 
 
387 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  37.79 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 
392 aa  268  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  38.34 
 
 
387 aa  266  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.16 
 
 
407 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.66 
 
 
406 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
405 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  36.44 
 
 
394 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 
407 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  36.3 
 
 
410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
409 aa  248  9e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 
396 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  36.25 
 
 
400 aa  242  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  34.61 
 
 
396 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  34.91 
 
 
878 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  34.91 
 
 
878 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  35.2 
 
 
399 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
395 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  34.95 
 
 
399 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  32.42 
 
 
508 aa  225  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  33.76 
 
 
393 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
399 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.51 
 
 
423 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
398 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  32.16 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  31.75 
 
 
884 aa  213  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
407 aa  209  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.02 
 
 
394 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  32.24 
 
 
407 aa  206  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
395 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  29.82 
 
 
431 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  33.52 
 
 
395 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  31.06 
 
 
401 aa  203  4e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 
395 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
384 aa  202  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.16 
 
 
407 aa  199  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  29.93 
 
 
409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 
393 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 
396 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>