20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1221 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 779 aa  1539    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  49.75 
 
 		 730 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  38.8 
 
 		 776 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  39.78 
 
 		 768 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  37.52 
 
 		 758 aa  308  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  40.1 
 
 		 708 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.12 
 
 		 8871 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.12 
 
 		 2000 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  25.86 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.2 
 
 		 593 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  24.25 
 
 		 869 aa  50.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.97 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  25.46 
 
 		 389 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  30.08 
 
 		 1120 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.45 
 
 		 1113 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  23.57 
 
 		 406 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.19 
 
 		 1225 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.23 
 
 		 668 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2761  FG-GAP repeat protein  28.24 
 
 		 694 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0332  hypothetical protein  26.47 
 
 		 580 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>