39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3925 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  43.75 
 
 		 566 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  42.41 
 
 		 566 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  42.34 
 
 		 571 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  40.43 
 
 		 577 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  38.81 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  38.81 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  38.81 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  37.21 
 
 		 247 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 662 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  34.87 
 
 		 689 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  36.07 
 
 		 688 aa  148  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  34.72 
 
 		 757 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  36.12 
 
 		 670 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  35.11 
 
 		 658 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  34.05 
 
 		 615 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  34.06 
 
 		 616 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  34.06 
 
 		 616 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  33.62 
 
 		 619 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  33.04 
 
 		 618 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  33.48 
 
 		 655 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  34.96 
 
 		 729 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 688 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 618 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  22.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25.93 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.11 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3372  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.76 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.34 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.11 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.19 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.89 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  20.98 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  20.98 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  20.98 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  20.98 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1284  formate dehydrogenase-N subunit gamma  26.35 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.43156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3047  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25.75 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.37 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>