More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2680 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  100 
 
 		 105 aa  215  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  52.04 
 
 		 220 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  47.57 
 
 		 216 aa  90.9  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  51.28 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  43.56 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  50.62 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  42.55 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  42.57 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  46.32 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  43.69 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  46.81 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  41 
 
 		 271 aa  74.3  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  46.67 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  46.51 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  46.81 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  45.78 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  44.71 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  44.71 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  49.4 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  44.71 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.7 
 
 		 269 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  49.4 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  51.32 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  39 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  43.14 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.3 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.24 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  44.58 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  44.58 
 
 		 469 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.57 
 
 		 393 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  42.5 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  45.26 
 
 		 711 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  39 
 
 		 471 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  40.48 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 		 356 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 		 277 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.25 
 
 		 389 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  43.69 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  33.65 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  41.86 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  39.42 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  39.42 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  44.58 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.72 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  41.41 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 		 455 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  43.48 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 354 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 354 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.58 
 
 		 388 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  48.05 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.53 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>