More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2272 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  100 
 
 
391 aa  807    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  67.19 
 
 
399 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  67.19 
 
 
399 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  45.48 
 
 
385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  45.43 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  44.05 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  39.9 
 
 
393 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  39.67 
 
 
370 aa  269  8e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  41.85 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  40.73 
 
 
402 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  41.57 
 
 
383 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  41.35 
 
 
370 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  40.39 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  39.67 
 
 
370 aa  263  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  39.94 
 
 
370 aa  262  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  41.01 
 
 
383 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  39.78 
 
 
370 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  41.29 
 
 
383 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  39.67 
 
 
370 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  41.29 
 
 
383 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  41.29 
 
 
383 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  41.29 
 
 
383 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  40.73 
 
 
383 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  40.92 
 
 
383 aa  259  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  39.67 
 
 
370 aa  259  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  39.69 
 
 
416 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  39.29 
 
 
393 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  39.39 
 
 
370 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  39.39 
 
 
370 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  39.12 
 
 
393 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  41.01 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  37.82 
 
 
377 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  38.81 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  39.06 
 
 
384 aa  253  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  37.91 
 
 
373 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  37.36 
 
 
373 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  39.58 
 
 
373 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  38.69 
 
 
381 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 
370 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  38.76 
 
 
405 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  39.32 
 
 
384 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  37.27 
 
 
383 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  38.38 
 
 
404 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  38.38 
 
 
404 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  39.56 
 
 
394 aa  249  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  37.36 
 
 
372 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.9 
 
 
401 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  37.64 
 
 
373 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  37.64 
 
 
373 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  37.64 
 
 
373 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  37.53 
 
 
383 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  38.69 
 
 
408 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.26 
 
 
372 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  37.09 
 
 
373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  37.36 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.87 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  38.67 
 
 
416 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  36.81 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  36.65 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  35.54 
 
 
403 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.7 
 
 
376 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  36.81 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  35.78 
 
 
403 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  39.68 
 
 
382 aa  242  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  37.56 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  37.09 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  37.56 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.78 
 
 
406 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  35.29 
 
 
403 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  36.99 
 
 
410 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  37.56 
 
 
402 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  43.48 
 
 
311 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  36.6 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  34.81 
 
 
440 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  39.73 
 
 
402 aa  237  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  39.73 
 
 
402 aa  237  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  37.4 
 
 
396 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  39.73 
 
 
402 aa  236  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  36.11 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  36.59 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.02 
 
 
395 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.52 
 
 
381 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  37.16 
 
 
425 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  37.5 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  38.13 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  38.61 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  36.79 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  36.53 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  36.39 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  38.11 
 
 
394 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  38.11 
 
 
394 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  37.34 
 
 
411 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  38.69 
 
 
382 aa  233  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  37.41 
 
 
424 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  38.69 
 
 
382 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  36.08 
 
 
402 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>