More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1873 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1873  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.474423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2624  30S ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 138 aa  219  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000552514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2912  ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000187241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  75.57 
 
 		 136 aa  204  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  76.56 
 
 		 135 aa  201  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  72.39 
 
 		 135 aa  200  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  72.09 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  76.8 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  75.59 
 
 		 128 aa  197  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  76.61 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  76 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  75.59 
 
 		 128 aa  196  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  196  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 127 aa  196  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  76 
 
 		 126 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  195  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  72.39 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  194  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  193  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  193  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  193  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  72.18 
 
 		 137 aa  193  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  68.79 
 
 		 142 aa  193  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  193  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1863  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000968975  normal  0.252117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 125 aa  193  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 126 aa  193  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  69.59 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  76.42 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  69.59 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 125 aa  191  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>