More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0096 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  100 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.22 
 
 
224 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  42.66 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  42.4 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  40.74 
 
 
215 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  40.09 
 
 
235 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  44.78 
 
 
221 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  42.4 
 
 
221 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  42.4 
 
 
221 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  41.94 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  42.4 
 
 
220 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.61 
 
 
227 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  41.94 
 
 
220 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  46 
 
 
229 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  45.31 
 
 
228 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.26 
 
 
227 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.03 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.07 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  37.24 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  36.84 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  36.84 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  40.28 
 
 
253 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.5 
 
 
256 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.52 
 
 
456 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
248 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.89 
 
 
456 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.98 
 
 
456 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  36.75 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  35.81 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.04 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  35.81 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1907  HAD superfamily hydrolase  29.69 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.52 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.52 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.52 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.52 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.52 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  26.6 
 
 
209 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  35.29 
 
 
224 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  35.29 
 
 
224 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  35.29 
 
 
224 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.29 
 
 
224 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  35.29 
 
 
224 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.46 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  29.25 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.34 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.85 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.81 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.48 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 
217 aa  89  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  35.68 
 
 
762 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.79 
 
 
223 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
226 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.96 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.98 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  32.11 
 
 
236 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.93 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.98 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.76 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  31.43 
 
 
222 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.43 
 
 
222 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  36.14 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
248 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.66 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 
222 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 
222 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  31.43 
 
 
222 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  27.66 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
230 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  35.05 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.61 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.76 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.43 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  30.69 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  29.95 
 
 
219 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  34.01 
 
 
218 aa  85.5  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.86 
 
 
253 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  27.88 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  28.99 
 
 
222 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.56 
 
 
221 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37770  putative hydrolase  44.44 
 
 
222 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00140245  normal  0.135547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  27.6 
 
 
216 aa  85.1  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  35.07 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  30.14 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  30 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.73 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  29.82 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.53 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  29.58 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.1 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  29.58 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  29.58 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>