More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0004 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 422 aa  845    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  73.57 
 
 		 424 aa  621  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  75 
 
 		 422 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  68.48 
 
 		 429 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  70.69 
 
 		 433 aa  604  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.67 
 
 		 431 aa  599  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  68.25 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.97 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  68.02 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  68.09 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  68.09 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 428 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  65.24 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  68.33 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  69.76 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  67.85 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  68.1 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  68.1 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.87 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  64.44 
 
 		 423 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 		 427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.48 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 433 aa  558  1e-158  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 		 437 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  67.95 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  64.75 
 
 		 430 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 		 434 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  67.23 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 433 aa  555  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.13 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.24 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  66.19 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  65.54 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  62.9 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  67.63 
 
 		 430 aa  551  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.13 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.59 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.13 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.59 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  63.13 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>