More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2500 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 308 aa  634    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  80.84 
 
 		 320 aa  530  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  75.97 
 
 		 321 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.43 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  67.11 
 
 		 317 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  67 
 
 		 317 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60 
 
 		 334 aa  387  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.11 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  59.54 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.54 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  58.55 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.54 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.84 
 
 		 351 aa  360  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.84 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.16 
 
 		 349 aa  355  6.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.09 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.58 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.43 
 
 		 338 aa  342  7e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  51.96 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  52.81 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  51.63 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  51.31 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  51.31 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.29 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  54.61 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  54.61 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.63 
 
 		 327 aa  331  7.000000000000001e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  52.75 
 
 		 343 aa  330  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  52.29 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  51.96 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  53.8 
 
 		 333 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  53.95 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  52.63 
 
 		 333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.8 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  53.82 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  52.79 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  52.13 
 
 		 334 aa  325  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  52.46 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  52.15 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.82 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.8 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  50.33 
 
 		 336 aa  322  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  51.82 
 
 		 332 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  52.09 
 
 		 336 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.09 
 
 		 336 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.8 
 
 		 336 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  51.82 
 
 		 334 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.41 
 
 		 325 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  51.49 
 
 		 337 aa  318  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  52.15 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.77 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 		 334 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  51.82 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.31 
 
 		 350 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  48.85 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  50.33 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  51.33 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.32 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  51 
 
 		 335 aa  311  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  50.83 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  49.02 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  51.33 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.32 
 
 		 313 aa  306  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  49.17 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  51.3 
 
 		 334 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  49.03 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  50 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  50.33 
 
 		 332 aa  305  8.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  50 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  47.73 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.34 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  45.72 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  49.51 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 		 334 aa  286  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  47.87 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  47.08 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  50.33 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  46.67 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.18 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  50 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.44 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  49.02 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.25 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.28 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.52 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  48.67 
 
 		 340 aa  275  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  45.93 
 
 		 326 aa  275  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  45.72 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  46.38 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.01 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  45.72 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  45.78 
 
 		 337 aa  275  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  46.43 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.63 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>