More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1631 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  83.24 
 
 
184 aa  316  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  84.83 
 
 
183 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  82.39 
 
 
184 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  75.57 
 
 
180 aa  285  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  73.14 
 
 
179 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  56.98 
 
 
180 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  54.91 
 
 
176 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  54.75 
 
 
181 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  54.75 
 
 
181 aa  200  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  54.75 
 
 
181 aa  200  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  54.19 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  54.19 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  54.19 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  55.06 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  55.06 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  54.75 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  53.93 
 
 
182 aa  198  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  53.07 
 
 
181 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  53.37 
 
 
182 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  55.49 
 
 
176 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  53.85 
 
 
181 aa  197  5e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  198  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  53.37 
 
 
182 aa  197  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  197  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 
181 aa  197  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  57.14 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  53.98 
 
 
177 aa  195  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  54.86 
 
 
177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  52.3 
 
 
176 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  54.55 
 
 
177 aa  194  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 
177 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  51.37 
 
 
183 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 
177 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  52.69 
 
 
185 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
185 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
185 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
185 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  52.69 
 
 
185 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  50.82 
 
 
183 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  52.69 
 
 
185 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
185 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
185 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
185 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
185 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  52.69 
 
 
185 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  50.26 
 
 
198 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  51.38 
 
 
183 aa  189  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  52.25 
 
 
193 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  52.87 
 
 
177 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 
176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  50.27 
 
 
183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  54.75 
 
 
177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  52.15 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  50.55 
 
 
184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  53.93 
 
 
183 aa  188  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  52.72 
 
 
183 aa  188  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  49.74 
 
 
193 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  52.72 
 
 
183 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  52.72 
 
 
183 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  50.27 
 
 
183 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  52.3 
 
 
177 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  52.54 
 
 
183 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  52.54 
 
 
183 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  52.54 
 
 
183 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  52.54 
 
 
183 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 
177 aa  187  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  52.57 
 
 
176 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
185 aa  187  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
185 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
185 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  52.84 
 
 
194 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  52.57 
 
 
176 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  50.26 
 
 
194 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  51.91 
 
 
202 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  52.87 
 
 
179 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  53.71 
 
 
199 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  52.02 
 
 
175 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  52.72 
 
 
183 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  53.89 
 
 
175 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  53.65 
 
 
203 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  55.43 
 
 
196 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  51.63 
 
 
183 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>