185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0668 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  100 
 
 		 76 aa  147  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  60.34 
 
 		 62 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  51.56 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  45 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  47.37 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  47.46 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  33.9 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  46.94 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  48.08 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  46.55 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0402  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0377  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  39.66 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0688  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  39.66 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>