More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0603 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  45.99 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  50.75 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  43.36 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  48.15 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  49.62 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  39.58 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  39.58 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  39.58 
 
 		 167 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  48.51 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  47.76 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  46.72 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  45.52 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  42.22 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  41.73 
 
 		 176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  43.7 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  40.88 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  43.97 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  45.53 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  43.26 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  39.72 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  45.53 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  39.85 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  37.33 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  37.33 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  38.36 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  40.3 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  36.67 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  44.26 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  38.1 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  42.55 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  41.73 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  44.63 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  44.63 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  35.92 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  38.46 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  40.94 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  38.46 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  41.79 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  42.62 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  33.55 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  45.38 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  44.54 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  34.69 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  42.14 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  39.04 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  38.57 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  44.54 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  41.8 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  32.61 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  43.7 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  40.98 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  35.71 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  42.86 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  42.02 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  40.94 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  40.15 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  39.31 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  36.49 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  39.42 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  39.42 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  36.49 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  36.89 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  36.49 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  37.59 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  38.81 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  40.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 174 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 237 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  38.06 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  38.58 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  39.37 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  39.37 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>