34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2706 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  64.83 
 
 		 214 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  68.91 
 
 		 325 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  50.3 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  41.96 
 
 		 439 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  32.76 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  33.05 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  31.58 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  31.36 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  29.73 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  28.95 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  28.32 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  28.32 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  28.32 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  28.32 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  26.96 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  30.97 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.36 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  25.22 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  31.58 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  31.86 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  34.44 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  31.48 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  28.7 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  29.81 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2008  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  26.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2113  hypothetical protein  26.61 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.517967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0077  PDP protein  28.66 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>