71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1211 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1211  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  100 
 
 		 323 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0852  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  54.01 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0194  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.6 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2313  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.6 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3528  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  50.61 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0829  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  48.32 
 
 		 494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.330153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0325  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  48.18 
 
 		 501 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  47.08 
 
 		 482 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0139  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1279  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  32.8 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.290847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1355  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.18 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.420984  normal  0.358131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0400  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.67 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0814  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.38 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.39 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.99 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.59 
 
 		 276 aa  169  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0088  heterodisulfide reductase subunit  32.78 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17790  4Fe-4S protein  31.58 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2660  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.11 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.403976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3428  heterodisulfide reductase subunit  31.99 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1031  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  30.99 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1258  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.3 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.94097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1111  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  30.31 
 
 		 276 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.346236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.13 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.87 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1832  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  23.33 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1797  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.812757  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  22.54 
 
 		 375 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.25 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1138  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.25 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.97 
 
 		 374 aa  89.7  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1144  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.54 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.592396  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1377  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.2 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00118672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0296  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  32 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.510341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0542  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.75 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0607  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.45 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1623  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  33.6 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  27.05 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2020  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  31.45 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1058  hypothetical protein  22.97 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.550841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1378  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  32.09 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0462  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  31.2 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.522633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.28 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1814  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  30.65 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1330  formate dehydrogenase  24.31 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.342648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0195  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  32 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0550447  decreased coverage  0.000288361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0924  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  30.39 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000725534 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0419  Formate dehydrogenase  32.17 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1562  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  20.11 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0980  Formate dehydrogenase  19.88 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000894314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1044  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.45 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0606051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  28.1 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1380  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.31 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2022  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  28.24 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307444  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3237  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  29.67 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  23.3 
 
 		 1271 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.12 
 
 		 981 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.22 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  27.52 
 
 		 712 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  29.41 
 
 		 852 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28 
 
 		 428 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.98 
 
 		 786 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.28 
 
 		 890 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0304  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.51 
 
 		 443 aa  42.4  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.980459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>