216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0871 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  276  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  43.48 
 
 
452 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  42.03 
 
 
269 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  40.58 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  42.55 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  42.55 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  41.3 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  41.38 
 
 
378 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  42.07 
 
 
268 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  37.68 
 
 
281 aa  94  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  41.3 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  42.55 
 
 
141 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  43.48 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  41.3 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  41.55 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  42.75 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  37.24 
 
 
263 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 
267 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
269 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  40.43 
 
 
278 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  40.58 
 
 
141 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  41.55 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  40.14 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  39.86 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  37.76 
 
 
374 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  38.41 
 
 
270 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  42.03 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  40.85 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  40.85 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  38.85 
 
 
272 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  34.53 
 
 
274 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.85 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  40.85 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  40.43 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  40.14 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  36.96 
 
 
269 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  39.57 
 
 
155 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  40.58 
 
 
141 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  38.13 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
278 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  39.01 
 
 
278 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  38.85 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  41.84 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  37.68 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  38.13 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  39.86 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  42.55 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  38.19 
 
 
265 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  38.19 
 
 
265 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  39.72 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  38.41 
 
 
268 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  37.68 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  41.13 
 
 
279 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  34.75 
 
 
263 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  34.78 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  35.51 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  35.77 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  37.41 
 
 
276 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  41.01 
 
 
270 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  37.68 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.13 
 
 
262 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  35 
 
 
359 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  38.03 
 
 
262 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
263 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  38.03 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  38.03 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  38.03 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  38.03 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  38.03 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  38.03 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  37.96 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  40.14 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  34.51 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  37.41 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  36.43 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  36.43 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  36.43 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  37.5 
 
 
282 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  35.51 
 
 
269 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  34.06 
 
 
270 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  34.29 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  36.81 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  31.65 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  31.94 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  34.75 
 
 
267 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  37.59 
 
 
290 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  31.91 
 
 
263 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.25 
 
 
263 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  30.5 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  33.1 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  33.79 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  36.43 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  35.17 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  32.62 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  35.17 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  36.81 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.81 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>