More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2398 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  68.53 
 
 		 716 aa  993    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  68.53 
 
 		 716 aa  993    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.38 
 
 		 716 aa  991    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.53 
 
 		 716 aa  992    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.38 
 
 		 714 aa  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.67 
 
 		 714 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  68.53 
 
 		 716 aa  993    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  67.13 
 
 		 726 aa  1018    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.53 
 
 		 714 aa  995    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.67 
 
 		 716 aa  996    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  69.81 
 
 		 732 aa  1037    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.67 
 
 		 716 aa  996    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  73.53 
 
 		 699 aa  1089    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  74.39 
 
 		 699 aa  1098    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  83.81 
 
 		 701 aa  1232    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  67.13 
 
 		 726 aa  1018    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  65.24 
 
 		 725 aa  974    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.24 
 
 		 716 aa  986    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.38 
 
 		 762 aa  992    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  67.13 
 
 		 726 aa  1018    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.67 
 
 		 714 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 715 aa  1463    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.67 
 
 		 714 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.28 
 
 		 690 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.76 
 
 		 690 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.17 
 
 		 708 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.33 
 
 		 690 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 		 690 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.51 
 
 		 691 aa  354  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.32 
 
 		 692 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.47 
 
 		 690 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.9 
 
 		 690 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.05 
 
 		 690 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.05 
 
 		 690 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.65 
 
 		 691 aa  347  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.05 
 
 		 690 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.94 
 
 		 686 aa  347  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.57 
 
 		 690 aa  347  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.05 
 
 		 690 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 692 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.46 
 
 		 691 aa  346  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.66 
 
 		 707 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.77 
 
 		 711 aa  343  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.84 
 
 		 703 aa  340  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.52 
 
 		 691 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  32.77 
 
 		 691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.17 
 
 		 714 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.65 
 
 		 725 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.17 
 
 		 714 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.58 
 
 		 714 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  32.92 
 
 		 714 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.75 
 
 		 721 aa  328  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.43 
 
 		 714 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.43 
 
 		 714 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.92 
 
 		 714 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.15 
 
 		 714 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.72 
 
 		 714 aa  325  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.21 
 
 		 714 aa  324  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.06 
 
 		 694 aa  323  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.12 
 
 		 700 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  32.72 
 
 		 750 aa  317  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.68 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.81 
 
 		 712 aa  313  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.28 
 
 		 720 aa  313  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.5 
 
 		 716 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.93 
 
 		 710 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.46 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.37 
 
 		 738 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.29 
 
 		 758 aa  278  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.93 
 
 		 741 aa  277  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.38 
 
 		 729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  29.11 
 
 		 664 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.31 
 
 		 832 aa  228  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.05 
 
 		 929 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  29.74 
 
 		 639 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  28.72 
 
 		 646 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  28.18 
 
 		 843 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.79 
 
 		 930 aa  201  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.82 
 
 		 927 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.61 
 
 		 934 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.23 
 
 		 934 aa  197  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.13 
 
 		 934 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.3 
 
 		 934 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  28.47 
 
 		 840 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  29.2 
 
 		 631 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  29.51 
 
 		 643 aa  193  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  29.61 
 
 		 633 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.85 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  29.17 
 
 		 664 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  26.08 
 
 		 636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  29.46 
 
 		 633 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  28.96 
 
 		 636 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.25 
 
 		 929 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.96 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  28.96 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  28.96 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  28.96 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  28.96 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  28.96 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  29.19 
 
 		 635 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>