89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0609 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
154 aa  310  7e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  47.97 
 
 
150 aa  142  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  42.58 
 
 
165 aa  141  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  47.59 
 
 
152 aa  138  2e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  44.97 
 
 
157 aa  134  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  133  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  41.94 
 
 
165 aa  127  7e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  37.32 
 
 
145 aa  110  7e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  38.03 
 
 
145 aa  108  2e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  37.32 
 
 
145 aa  108  2e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  37.14 
 
 
143 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  44.83 
 
 
152 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  47.24 
 
 
152 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  46.46 
 
 
152 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  35.17 
 
 
151 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  41.78 
 
 
148 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  43.84 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  68.9  2e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  32.43 
 
 
147 aa  67.4  7e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  28.19 
 
 
153 aa  61.2  5e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  31.13 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  57.8  6e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  38.89 
 
 
121 aa  55.8  2e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.85 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  31.29 
 
 
145 aa  55.1  4e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  29.66 
 
 
153 aa  54.7  4e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  29.05 
 
 
147 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  27.15 
 
 
150 aa  53.5  1e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  31.58 
 
 
151 aa  51.6  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  31.94 
 
 
140 aa  52  3e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  31.94 
 
 
140 aa  51.6  4e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.52 
 
 
142 aa  51.2  5e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.52 
 
 
142 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  36.96 
 
 
153 aa  51.2  5e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  50.8  6e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  31.03 
 
 
459 aa  50.8  7e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25.52 
 
 
142 aa  50.8  7e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25.52 
 
 
142 aa  50.8  7e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  50.1  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  25.17 
 
 
142 aa  50.1  1e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  30.56 
 
 
149 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  30.56 
 
 
149 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  30.23 
 
 
149 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  30.56 
 
 
149 aa  49.3  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  30.34 
 
 
147 aa  48.9  3e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  30.34 
 
 
147 aa  48.9  3e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  28.28 
 
 
153 aa  48.9  3e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  3.02368e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  48.1  5e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  28.48 
 
 
153 aa  48.1  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  31.08 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  29.79 
 
 
464 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  25.34 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  25.17 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  25.17 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  23.97 
 
 
510 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  27.97 
 
 
496 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  25.83 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  28.77 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  27.52 
 
 
446 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  26.24 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  29.58 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  26.32 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  29.53 
 
 
448 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  28.38 
 
 
449 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  24.29 
 
 
144 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  29.53 
 
 
448 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  27.4 
 
 
153 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  28.95 
 
 
143 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  36.36 
 
 
150 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  21.09 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  25.17 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  36.17 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  26.71 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  32.03 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  25.37 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  36.17 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  28.08 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  29.22 
 
 
489 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  28.39 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1846  hypothetical protein  23.87 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204323  normal  0.0132683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.60855e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  27.21 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  25.4 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>