More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2675 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  79.37 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  77.42 
 
 		 62 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  73.02 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  69.84 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  66.15 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  61.9 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  56.92 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 94 aa  67  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  55.93 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  55.93 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  47.69 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  54.24 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  54.24 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>