40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5289 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  100 
 
 		 275 aa  537  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  55.47 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  38.85 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  38.91 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  39.21 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  39.21 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  35.06 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  35.42 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  36.53 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0636  putative transmembrane protein  36.31 
 
 		 171 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  34.18 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  29.37 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  31.7 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  29.52 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  29.17 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  29.27 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  27.53 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  28.84 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  29.55 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  28.46 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  25.45 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  35.9 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  54.93 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  30.86 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  22.05 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  29.15 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  29.7 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  27.94 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  26.04 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  24.54 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  25.09 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  26.24 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  26.32 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  24.81 
 
 		 240 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  24.33 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  31.53 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  25.48 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  25.27 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>