More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7281 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  66.24 
 
 
236 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  67.23 
 
 
238 aa  337  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  66.11 
 
 
240 aa  333  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 
229 aa  277  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  57.51 
 
 
227 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  57.51 
 
 
227 aa  268  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  60.09 
 
 
238 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  53.42 
 
 
244 aa  261  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  52.38 
 
 
393 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  52.3 
 
 
280 aa  253  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  55.13 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  48.95 
 
 
230 aa  225  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  48.71 
 
 
226 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  48.72 
 
 
227 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  48.52 
 
 
230 aa  222  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  48.29 
 
 
227 aa  221  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  45.76 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  42.29 
 
 
519 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  42.52 
 
 
527 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  47.44 
 
 
227 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  42.13 
 
 
531 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  41.79 
 
 
271 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  41.79 
 
 
271 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  40.32 
 
 
527 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  42.44 
 
 
685 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
234 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
235 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
235 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  42.29 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  43.53 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
514 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
411 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30.74 
 
 
410 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.74 
 
 
382 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
340 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.54 
 
 
410 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.6 
 
 
410 aa  99  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
340 aa  98.6  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
347 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
414 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
420 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
340 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
374 aa  95.9  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
378 aa  94.4  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  35.51 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
394 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
358 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
314 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
301 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
287 aa  89  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
304 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
338 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  28.95 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
476 aa  88.6  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.77 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  32.48 
 
 
253 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
472 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  28.05 
 
 
332 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
329 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
311 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
271 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
448 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
338 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.43 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
235 aa  85.9  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  29.06 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
301 aa  85.9  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  28.22 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
319 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  27.48 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
336 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.29 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  25.71 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>