26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2831 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  100 
 
 		 483 aa  990    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  45.09 
 
 		 486 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  34.72 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  32.85 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  32.77 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  26.28 
 
 		 617 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  24.3 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  24.07 
 
 		 465 aa  90.1  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  22.45 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  21.29 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01190  outer membrane component of multidrug efflux pump  22.3 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  20.82 
 
 		 524 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 528 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.12 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 446 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  21.76 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.84 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 590 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  22.73 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.84 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.84 
 
 		 471 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.84 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>