More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3549 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3549  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0189328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.05 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.38 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  41.38 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.38 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.23 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  40.23 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01690  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.16 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.23 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.5 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.08 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  37.5 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  40.23 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2307  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0458616  normal  0.112243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2283  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.83 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2076  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  42.17 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4827  phosphocarrier, HPr family  37.93 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0331  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.48 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  35.63 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0602  HPrNtr  39.08 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  32.5 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0882  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.71 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000535519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2443  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  36.78 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14490  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00608366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  35.63 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.56 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.58 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0323  phosphocarrier, HPr family  36.25 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.76 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0254  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0669  phosphocarrier protein HPr  37.33 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.829245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1429  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  39.74 
 
 
85 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1350  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  31.87 
 
 
835 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0318787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0333  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.96 
 
 
85 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3771  HPr family phosphocarrier protein  36.78 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl565  phosphotransferase system phosphohistidine-containing protein  37.33 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217901  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2016  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.25 
 
 
111 aa  59.3  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.48 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  36 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  35.53 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1738  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.07 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0167  HPrNtr  34.48 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5267  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2961  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.97 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  34.94 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4027  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.47 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0620705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2967  phosphocarrier protein Chr  32.93 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000334349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  32.18 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  32.18 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  37.33 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  37.33 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  33.33 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  32.18 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1021  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.5 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1091  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.78 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  32.18 
 
 
89 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  32.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  32.18 
 
 
89 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  33.33 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1786  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  36.76 
 
 
838 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.751715  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0433  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.76 
 
 
838 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  37.21 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  32.18 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  32.18 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1923  HPr family phosphocarrier protein  36.47 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1641  phosphocarrier protein (Hpr)  36.47 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3695  phosphocarrier protein Chr  33.33 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.75 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  33.77 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  37.33 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.48 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  35.82 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3989  phosphotransferase system HPr enzyme  31.03 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4110  PTS system HPr enzyme  31.03 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.556155  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  33.77 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>