More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2961 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2961  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
92 aa  184  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1091  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.24 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2967  phosphocarrier protein Chr  36.36 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000334349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0669  phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.829245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1738  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.67 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2895  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.55 
 
 
819 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00460973 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  34.57 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  34.57 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.79 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1090  HPrNtr  42.25 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  36.14 
 
 
89 aa  60.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.02 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.94 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.21 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  35.71 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  37.18 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  36.47 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  37.18 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.11 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3549  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.97 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0189328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01690  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4116  phosphocarrier protein HPr  40.91 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  35.37 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  33.77 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4180  phosphocarrier protein HPr  40.91 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.89 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  34.15 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  34.15 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  28.41 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  35.06 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  35.06 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  34.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  34.18 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2748  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4094  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.77 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0707453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  35.06 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0716  phosphocarrier protein HPr  32.05 
 
 
89 aa  57  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  36.84 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.58 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1080  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2016  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.23 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  37.08 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3959  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4069  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.486642 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4268  phosphocarrier protein HPr  39.39 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0103  phosphocarrier protein HPr  35.06 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0536118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  33.77 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  32.93 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  33.77 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0333  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.14 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  31.17 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3108  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.24 
 
 
846 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.899146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  33.77 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  35.06 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.77 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1243  phosphocarrier protein HPr  36.76 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.691712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  39.13 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.71 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2439  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.17 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0660823  normal  0.0766311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.5 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3191  PTS system phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase subunit Hpr  31.17 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0158235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3314  phosphocarrier, HPr family  36.23 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.71 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  38.57 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  31.71 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.77 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5271  phosphocarrier protein Chr  30.38 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0913  phosphocarrier protein HPr  38.33 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl565  phosphotransferase system phosphohistidine-containing protein  33.33 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.06 
 
 
88 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2283  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.95 
 
 
88 aa  52  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1098  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  33.33 
 
 
236 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.38 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.17 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0773  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.14 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106388  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2443  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.95 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.57 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4945  phosphocarrier protein Chr  31.08 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0360  phosphocarrier, HPr family  35.53 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>