209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3167 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  50.68 
 
 
267 aa  241  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  52.68 
 
 
267 aa  240  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2142  AzlC family protein  51.92 
 
 
236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.457297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  43.05 
 
 
227 aa  201  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  39.91 
 
 
243 aa  175  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1930  AzlC family protein  42.86 
 
 
230 aa  175  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  36.94 
 
 
319 aa  165  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  38.12 
 
 
235 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  35.24 
 
 
224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  35.12 
 
 
251 aa  128  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  40.23 
 
 
236 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  33.65 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  30.66 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  34.78 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  33.16 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  33.66 
 
 
248 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  32.6 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.98 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.79 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  34.3 
 
 
233 aa  92  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.31 
 
 
250 aa  91.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  32.11 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.41 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  30.53 
 
 
243 aa  89  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.79 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  33.33 
 
 
243 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  30.59 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  31.76 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  25.81 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  25.35 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  25.35 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  25.35 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  25.35 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  25.35 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  25.35 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  28.49 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  25 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  26.7 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  25.35 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  30.1 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  25.35 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  24.88 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  31.55 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  33.14 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  27.18 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  25.68 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  26.61 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  30.95 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  26.44 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  28.33 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  27.68 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30.17 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.35 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  27.18 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  32.16 
 
 
250 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  28.09 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  32.16 
 
 
280 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  27.05 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  27.05 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  29.95 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  32.16 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  28.22 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  27.69 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  27.69 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  27.69 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  26.78 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  31.98 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.25 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  31.58 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  25.85 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  29.06 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  27.64 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  28.57 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  30.81 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  30.36 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  26.13 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  30.41 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  26.23 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  27.32 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  29.76 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  25.87 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  25.26 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  30 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  26.74 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0119  AzlC family protein  26.67 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  25.49 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  28.49 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  23.16 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  24.08 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  24.34 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  28.96 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  26.85 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  26.85 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  29.82 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  26.63 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.67 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  29.48 
 
 
286 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  29.67 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>