34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2618 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  100 
 
 
399 aa  807    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  40.3 
 
 
466 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  38.96 
 
 
390 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.51 
 
 
4630 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  40 
 
 
730 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  36.2 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  31.15 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.39 
 
 
1821 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.82 
 
 
1279 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3510  Ig domain-containing protein  31.79 
 
 
811 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000494417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  24.44 
 
 
1361 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.64 
 
 
570 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.55 
 
 
1009 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  27.49 
 
 
1300 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.23 
 
 
752 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  27.11 
 
 
892 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2588  hypothetical protein  26.76 
 
 
195 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  32.99 
 
 
1732 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
688 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  26 
 
 
867 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  33.59 
 
 
981 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  34.18 
 
 
1048 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  45.1 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  24.3 
 
 
1316 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3064  hypothetical protein  36.23 
 
 
218 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  30.85 
 
 
576 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  30.6 
 
 
220 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  40.96 
 
 
526 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.45 
 
 
2042 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 
1776 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  29.55 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3475  Ig domain-containing protein  27.96 
 
 
842 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  33.72 
 
 
2638 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  22.95 
 
 
12684 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>