16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3510 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3510  Ig domain-containing protein  100 
 
 
811 aa  1592    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000494417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3509  Ig domain-containing protein  45.67 
 
 
817 aa  579  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3112  S-layer domain protein  31.12 
 
 
932 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000330769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  27.51 
 
 
814 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  27.56 
 
 
814 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  27.56 
 
 
814 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  29.37 
 
 
807 aa  91.3  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  31.79 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  33.91 
 
 
4630 aa  58.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.87 
 
 
1821 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3475  Ig domain-containing protein  31.73 
 
 
842 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
1279 aa  47.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  60 
 
 
262 aa  47.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  25.71 
 
 
657 aa  44.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  44.44 
 
 
1937 aa  44.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  44.44 
 
 
1467 aa  44.3  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>