205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1443 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1443  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  63.07 
 
 		 414 aa  360  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  62.72 
 
 		 415 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  60.98 
 
 		 417 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  60.98 
 
 		 415 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  60.98 
 
 		 417 aa  351  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  60.98 
 
 		 414 aa  351  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  60.98 
 
 		 417 aa  349  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  60.98 
 
 		 415 aa  349  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  60.28 
 
 		 414 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 424 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  30.29 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 413 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 413 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 418 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  27.27 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 422 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.28 
 
 		 422 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  26.01 
 
 		 422 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  26.74 
 
 		 422 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  26.74 
 
 		 422 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.74 
 
 		 422 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  26.74 
 
 		 422 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  26.01 
 
 		 422 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 433 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  26.37 
 
 		 422 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 432 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 427 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 405 aa  89  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 405 aa  89  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 444 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.61 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2128  hypothetical protein  22.36 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25.56 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  20.08 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  26.04 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  26.04 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  26.04 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  26.04 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 405 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25.84 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  26.04 
 
 		 434 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  19.69 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.51 
 
 		 1829 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.29 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  19.69 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  19.69 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.35 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  19.69 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0293  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0337  major facilitator superfamily permease  25.09 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  22.94 
 
 		 1769 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.37 
 
 		 1876 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  23.53 
 
 		 1864 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.39 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  25.2 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  20.72 
 
 		 1806 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  22.96 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  18.92 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  18.92 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  25 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.71 
 
 		 1839 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 430 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  18.53 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  18.53 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.54 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.54 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.26 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 499 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.6 
 
 		 415 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  25.64 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.09 
 
 		 419 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.09 
 
 		 419 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 429 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4757  major facilitator superfamily MFS_1, putative  27.36 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3256  putative permease  25.09 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 412 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.38 
 
 		 419 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 415 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 414 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.81 
 
 		 415 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.81 
 
 		 415 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.81 
 
 		 415 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>