36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0488 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  68.06 
 
 		 223 aa  288  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  56.62 
 
 		 218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  57.28 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  55.5 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  60.58 
 
 		 226 aa  234  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  59.51 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  38.14 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  28.92 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  27.23 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  26.02 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  27.94 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  27.8 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  27.96 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3714  hypothetical protein  26.9 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  29.68 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1815  phosphatidate cytidylyltransferase  31.12 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  25.77 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  26.17 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  25.7 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  30.43 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  29.22 
 
 		 387 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  26.47 
 
 		 381 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0763  phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149439  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  27.16 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  25 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  24.87 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1487  hypothetical protein  24.88 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  23.43 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  26.32 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  27.96 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  24.88 
 
 		 444 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>