15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3714 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3714  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  384  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1986  dolichol kinase-like protein  76.53 
 
 
196 aa  258  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00109651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0797  hypothetical protein  48.6 
 
 
190 aa  140  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1487  hypothetical protein  42.03 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0292  dolichol kinase-like protein  40.39 
 
 
208 aa  106  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.395048  normal  0.245346 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0270  hypothetical protein  31.37 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  24.49 
 
 
199 aa  58.9  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  27.14 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  28.8 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  26.4 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  30.4 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  27.51 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  27.54 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  22.73 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  24.35 
 
 
269 aa  42  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>