More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0355 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  44.11 
 
 
864 aa  692  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  45.53 
 
 
789 aa  729  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  54.42 
 
 
811 aa  862  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3270  ATP-dependent chaperone ClpB  44.71 
 
 
857 aa  672  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.97344e-05  normal  0.063711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  51.79 
 
 
823 aa  795  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  45.17 
 
 
894 aa  704  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  4.1024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  54.55 
 
 
811 aa  863  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  44.42 
 
 
866 aa  691  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  42.45 
 
 
867 aa  663  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  44.88 
 
 
857 aa  681  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68048e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  44.33 
 
 
857 aa  676  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  44.33 
 
 
857 aa  676  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.79848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  43.45 
 
 
864 aa  712  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  50.06 
 
 
813 aa  785  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  44.33 
 
 
857 aa  676  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  44.33 
 
 
857 aa  676  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  44.33 
 
 
857 aa  676  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  43.19 
 
 
872 aa  687  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  49.76 
 
 
822 aa  804  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  46.39 
 
 
792 aa  718  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3951  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.23 
 
 
868 aa  685  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  52.88 
 
 
806 aa  804  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.09164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  52.32 
 
 
810 aa  838  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  42 
 
 
878 aa  667  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  50.36 
 
 
830 aa  820  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  51.22 
 
 
825 aa  835  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  42.38 
 
 
899 aa  667  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  44.82 
 
 
826 aa  736  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  49.04 
 
 
834 aa  791  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  44.38 
 
 
861 aa  719  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  43.55 
 
 
864 aa  688  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.72053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  50.65 
 
 
826 aa  830  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  54.55 
 
 
811 aa  863  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  54.42 
 
 
811 aa  861  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  42.68 
 
 
890 aa  669  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  50.37 
 
 
821 aa  806  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  85.4 
 
 
846 aa  1450  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  86.72 
 
 
849 aa  1517  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  43.49 
 
 
879 aa  682  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  45.54 
 
 
792 aa  671  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  44.88 
 
 
857 aa  681  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.60565e-06  decreased coverage  6.35783e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  45.22 
 
 
857 aa  683  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.33942e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  43.79 
 
 
862 aa  679  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  52.67 
 
 
812 aa  862  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  52.38 
 
 
816 aa  848  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  54.55 
 
 
811 aa  866  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  45.22 
 
 
857 aa  683  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  48.15 
 
 
830 aa  761  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  42.92 
 
 
861 aa  669  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  48.66 
 
 
824 aa  776  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1121  ATPase AAA-2 domain protein  44.71 
 
 
857 aa  672  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0611865  normal  0.087173 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  48.17 
 
 
859 aa  796  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  44.87 
 
 
859 aa  694  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0503  ATPase  50.49 
 
 
837 aa  739  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  44.97 
 
 
822 aa  725  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  51.91 
 
 
820 aa  803  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  45 
 
 
791 aa  684  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  44.88 
 
 
857 aa  681  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 
853 aa  1727  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.16084e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0465  hypothetical protein  53.31 
 
 
842 aa  886  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  50.61 
 
 
869 aa  809  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  85.37 
 
 
849 aa  1460  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  51.66 
 
 
814 aa  800  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  41.85 
 
 
874 aa  664  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  41.84 
 
 
874 aa  663  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  54.47 
 
 
814 aa  889  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  44.88 
 
 
857 aa  680  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.39096e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  50.29 
 
 
860 aa  827  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  49.16 
 
 
839 aa  857  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  42.94 
 
 
865 aa  673  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  51.37 
 
 
840 aa  822  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  43.39 
 
 
872 aa  665  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  43.99 
 
 
857 aa  677  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  42.39 
 
 
874 aa  672  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  51.65 
 
 
844 aa  833  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  52.01 
 
 
824 aa  838  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  51.71 
 
 
835 aa  863  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  48.96 
 
 
824 aa  771  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  46.7 
 
 
812 aa  744  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  51.3 
 
 
852 aa  835  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  46.21 
 
 
815 aa  744  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  51.15 
 
 
820 aa  818  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  43.86 
 
 
867 aa  669  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  50.18 
 
 
819 aa  809  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  43.29 
 
 
871 aa  689  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.52857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.58 
 
 
858 aa  814  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  52.25 
 
 
837 aa  862  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  45.2 
 
 
880 aa  684  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1343  ATPase AAA-2 domain protein  71.71 
 
 
850 aa  1152  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  43.44 
 
 
857 aa  679  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  49.64 
 
 
848 aa  819  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5924  ATP-dependent chaperone ClpB  43.12 
 
 
880 aa  674  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.06 
 
 
862 aa  812  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  66.59 
 
 
843 aa  1124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  50.55 
 
 
868 aa  818  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  42.47 
 
 
872 aa  689  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  43.24 
 
 
894 aa  674  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  47.99 
 
 
815 aa  763  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11148  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  60.07 
 
 
848 aa  1033  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  52.06 
 
 
836 aa  848  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>